夏日的一天,红发女孩玛丽(杉咲花 配音)被送到阿姨夏洛特所在的乡间小屋度假。初来乍到,玛丽对周遭的()一切还不那么适应,特别是调皮男孩彼得(神木隆之介 配音)有意()和她对着干,令玛丽实在高兴不起()来。偶然一次()的林间()探险,玛丽见到了传说中的魔法之花“夜间飞行”,还()找到了一柄()破()扫帚。偏偏这把魔法扫帚载着玛丽飞上天空,来到了()专门培养()魔法师的恩德学园。在这个神奇的所在,玛丽受到曼布勒切克女士(天海佑希 配音)的殷勤接待,还邂逅了怪模怪样的D博士(小日向文世 配音)。虽然女孩懵懵懂懂成为了魔法学员,可是他很快发现了这里所隐藏的()秘密……
本片根据改编自玛丽·斯图()尔特的英国儿童文学小说改编,是米林宏昌离开吉()卜力工作室后制()作拍摄的第一部动()画长片。